Análisis de Datos de Secuenciación Másiva
¿Que se aborda en el curso?
- Introducción a las tecnologias de secuenciación de segunda y tercera generación
- Introducción a UNIX/LINUX
- Control de cálidad de datos de secuenciación (FASTQC y MULTIQC)
- Ensamble de RNA-seq (Trinity)
- Análisis de genes expresados diferencialmente (Kallsito, RSEM, DESeq2 y EdgeR)
- Homologia de genes, ontología génica y enriquecimiento funcional (Blast, Trinotate, TopGO, DAVID, STRING)
- Secuenciación masiva de genes marcadores (Qiime, DADA)
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