Análisis de Datos de Secuenciación Másiva

¿Que se aborda en el curso?

  • Introducción a las tecnologias de secuenciación de segunda y tercera generación
  • Introducción a UNIX/LINUX
  • Control de cálidad de datos de secuenciación (FASTQC y MULTIQC)
  • Ensamble de RNA-seq (Trinity)
  • Análisis de genes expresados diferencialmente (Kallsito, RSEM, DESeq2 y EdgeR)
  • Homologia de genes, ontología génica y enriquecimiento funcional (Blast, Trinotate, TopGO, DAVID, STRING)
  • Secuenciación masiva de genes marcadores (Qiime, DADA)

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Instructores:

Miguel A. Tripp Valdez
Miguel A. Tripp Valdez
Posdoc
Programa de Acuicultura. CIBNOR
Pavel E. Galindo Torres
Pavel E. Galindo Torres
Posdoc
Programa de Acuicultura. CIBNOR.