Bienvenidos al Laboratorio de Genómica Funcional


Nuestras investigaciones se enfocan a estudiar la diversidad marina y los efectos de las variaciones ambientales sobre los organismos mediante en el uso de herramientas genómicas.



Acerca de nosotros

El Laboratorio de Genómica Funcional se encuentra dentro del Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada. Nuestros estudios se enfocan en uso de herramientas de secuenciación masiva para describir patrones de diversidad marina asi como estudiar los impactos de cambio climático, como el calentamiento y la acidificación del océano, en procesos fisiológicos en organismos marinos con relevancia ecológica y económica.


Nuestras líneas de investigación:

  • Efectos de las variaciones ambientales sobre organismos marinos mediante una aproximación genómica y transcriptómica

  • Impactos biológicos de la variabilidad térmica y clima extremo en ectotermos marinos bentónicos: Aptitud biológica, potencial de adaptación y plasticidad fenotípica.

Novedades

Equipo de Trabajo

Conoce nuestro grupo de investigación

Investigador Principal

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Clara Elizabeth Galindo Sánchez

Investigador titular

Biotecnología marina. CICESE

Estudio las adaptaciones fisiológicas y estrategias reproductivas ante el cambio climático, a nivel genómico y transcriptómico principalmente en invertebrados marinos

Estudiantes

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Alexis Eduardo Trejo Estrada

Estudiante de Doctorado

Ciencias de la Vida. CICESE

Me interesa estudiar la fisiología e identificar el microbioma asociado al holobionte coralino que les permite tolerar y desarrollarse en ambientes marginales.

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Giselle Moreno López

Estudiante de maestría

Ciencias de la Vida. CICESE

Soy bióloga marina y estoy interesada en la biología molecular, en especial desde un enfoque evolutivo. Actualmente formo parte del proyecto de la almeja mano de León.

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Grecia D. Sánchez Rosales

Estudiante de maestría

Ciencias de la Vida. CICESE

Me encuentro realizando un estudio de genómica funcional de la especie Nodipecten subnodosus

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Hector Raul Santos Cervera

Estudiante de maestría

Acuicultura. CICESE

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José Manuel Morales

Estudiante de doctorado

Ciencias de la Vida. CICESE

Estudio la conectividad genética del lenguado Bothus robinsi en el Golfo de México, utilizando RADseq

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Mayela Manzano Mora

Estudiante de Doctorado

Acuicultura. CICESE

Evaluaré la resiliencia del abulón rojo (Haliotis rufescens), cultivado en mar abierto y laboratorio, desde un aproximación ómica.

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Ricardo Goméz Reyes

Estudiante de doctorado

UABC

Me interesa estudiar la susceptibilidad de los organismos marinos expuestos a las co-variables del cambio climático, en especial la acidificación oceánica (AO).

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Román Díaz Polo

Estudiante de maestría

Ciencias de la Vida. CICESE

Mi interés es comprender los procesos ecológicos y evolutivos de especies sometidas a una explotación pesquera y su relación con cambios ambientales.

Posdoctorantes

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Paulina Mejia Ruiz

Posdoc

Biotecnología Marina. CICESE.

Técnicos de Laboratorio

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Edna Sanchéz Castrejón

Técnico

Biotecnología marina. CICESE

Colaboradores

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Miguel A. Tripp Valdez

Posdoc

Programa de Acuicultura. CIBNOR

Estudio los impactos de los cambios ambientales derivados de las actividades antropogénicas en la fisiología y capacidad de respuesta de organismos marinos.

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Claudia Ventura López

Posdoc

Biotecnología marina. CICESE

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Armando Mendoza Flores

Posdoc

Acuicultura. CICESE

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Carmen E. Vargas Peralta

Responsable de Laboratorio

Acuicultura. CICESE.

Estudio la trazabilidad genética de abulones en el Noroeste del Pácifico mediante marcadores SNPs.

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Fabiola Lafarga De La Cruz

Investigador titular.

Acuicultura. CICESE

Estudio la variabilidad y estructura genética de poblaciones naturales y de cultivo de organismos acuáticos para establecer programas de crianza selectiva y mejoramiento genético.

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Fausto Valenzuela Quiñonez

Investigador titular.

Programa de Ecología Pesquera. CIBNOR

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Miguel A. Martinez Mercado

Posdoc

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Oscar E. Juárez

Posdoc

Me interesa comprender las respuestas biológicas, desde el nivel molecular hasta el ecosistémico, de organismos marinos ante cambios ambientales.

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Pavel E. Galindo Torres

Posdoc

Programa de Acuicultura. CIBNOR.

Me interesa descubrir genes y estudiar su función empleando biotecnologías que caen dentro de la genómica funcional para el mejoramiento genético en especies acuicolas.

Proyectos de investigación

*
Todos Proyectos en curso Proyectos concluidos
Impacto de microplasticos en el ostión

Impacto de microplasticos en el ostión

Proyecto en colaboración con el Instituto de Investigaciones Oceanológica de la UABC

Diversidad de ictioplacton y zooplancton en el Golfo de México. Una aproximación metagenética y taxonómica

Diversidad de ictioplacton y zooplancton en el Golfo de México. Una aproximación metagenética y taxonómica

Fondo Sectorial CONACYT-Secretaria de Energía-Hidrocarburos

Efecto de la acidificación del océano sobre los mecanismos de regulación genética por microRNAs

Efecto de la acidificación del océano sobre los mecanismos de regulación genética por microRNAs

Proyecto en colaboración con el Instituto de Investigaciones Oceanológica de la UABC

Evaluación del efecto de la temperatura sobre los mecanismos moleculares y fisiológicos que regulan la reproducción de Octopus maya.

Evaluación del efecto de la temperatura sobre los mecanismos moleculares y fisiológicos que regulan la reproducción de Octopus maya.

Convocatoria Ciencia Básica SEP-CONACYT

Impactos biológicos de la variabilidad y extremos de temperatura en ectotermos marinos bentónicos. aptitud biológica, potencial de adaptación y plasticidad fenotípica

Impactos biológicos de la variabilidad y extremos de temperatura en ectotermos marinos bentónicos. aptitud biológica, potencial de adaptación y plasticidad fenotípica

Proyecto CONACYT Ciencia de Frontera CIBNOR CICESE

Metales pesados y microbioma gastrointestinal de elasmobranquios.

Metales pesados y microbioma gastrointestinal de elasmobranquios.

Save Our Seas Foundation

Lista de publicaciones

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J. Gasca-Pineda, C.E. Galindo-Sanchez, M.A. Martinez-Mercado, S.P.A. Jimenez-Rosenberg, C.M. Hereu, Y. Nakamura, S.Z. Herzka, J.C. Compaire, R. Gomez-Reyes, J. Robles-Flores, A. Saavedra-Flores, M.C. Arteaga (2023). Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding. In: Aquatic Ecology, (57), 1, pp. 149-164, https://doi.org/10.1007/s10452-022-10002-w.

G.-P. Jaime, C.E. Galindo-Sanchez, M.A. Martinez-Mercado, S.P.A. Jimenez-Rosenberg, C.M. Hereu, Y. Nakamura, S.Z. Herzka, J.C. Compaire, R. Gomez-Reyes, J. Flores-Robles, A. Saavedra-Flores, M.C. Arteaga (2023). Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding. In: Aquatic Ecology, https://doi.org/10.1007/s10452-022-10002-w.

G.-P. Jaime, C.E. Galindo-Sanchez, M.A. Martinez-Mercado, S.P.A. Jimenez-Rosenberg, C.M. Hereu, Y. Nakamura, S.Z. Herzka, J.C. Compaire, R. Gomez-Reyes, J. Robles-Flores, A. Saavedra-Flores, M.C. Arteaga (2023). Correction: Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding (Aquatic Ecology, (2023), 10.1007/s10452-022-10002-w). In: Aquatic Ecology, https://doi.org/10.1007/s10452-023-10005-1.

J. Gasca-Pineda, C.E. Galindo-Sanchez, M.A. Martinez-Mercado, S.P.A. Jimenez-Rosenberg, C.M. Hereu, Y. Nakamura, S.Z. Herzka, J.C. Compaire, R. Gomez-Reyes, J. Robles-Flores, A. Saavedra-Flores, M.C. Arteaga (2023). Correction: Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding (Aquatic Ecology, (2023), 57, 1, (149-164), 10.1007/s10452-022-10002-w). In: Aquatic Ecology, (57), 1, pp. 241, https://doi.org/10.1007/s10452-023-10005-1.

A. Mendoza-Flores, C.E. Galindo-Sanchez, M.P. Sanchez-Saavedra (2023). Effects of the Light Irradiance on the Growth and Lipid Content of Amphidinium carterae (Dinophyceae) for Biofuel Production. In: Bioenergy Research, (16), 1, pp. 348-356, https://doi.org/10.1007/s12155-022-10455-9.

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